Trước đó, ngày 09/12 Bộ trưởng Bộ NN&PTNT Lê Minh Hoan, Trưởng Ban Chỉ đạo đã chủ trì Phiên họp Ban Chỉ đạo của Bộ NN&PTNT về tổng kết việc thực hiện Nghị quyết số 18-NQ/TW ngày 25/10/2017 của Ban Chấp hành Trung ương khóa XII "Một số vấn đề về tiếp tục đổi mới, sắp xếp tổ chức bộ máy của hệ thống chính trị tinh gọn, hoạt động hiệu lực, hiệu quả" (Ban Chỉ đạo).
Bộ trưởng, Trưởng Ban chỉ đạo kết luận, về công tác quản lý công chức, viên chức, tạm dừng việc tuyển dụng, tiếp nhận công chức, viên chức; bổ nhiệm, cán bộ, công chức, viên chức giữ chức vụ cao hơn hoặc cho chủ trương kiện toàn các chức danh lãnh đạo, quản lý của Bộ và các đơn vị thuộc Bộ kể từ ngày 1/12 đến khi hoàn thành việc sắp xếp tổ chức bộ máy của cơ quan, tổ chức, đơn vị và của Bộ.
Trường hợp thực sự cần thiết, Ban cán sự đảng, Lãnh đạo Bộ căn cứ vào tình hình đội ngũ cán bộ và yêu cầu nhiệm vụ cụ thể để xem xét, quyết định đối với các chức danh lãnh đạo, quản lý thuộc thẩm quyền quản lý của Ban cán sự đảng, Lãnh đạo Bộ. Đối với các chức danh lãnh đạo, quản lý do các đơn vị quyết định, tập thể lãnh đạo đơn vị cần rà soát chặt chẽ, kỹ lưỡng về cơ cấu, số lượng, nhân sự, yêu cầu nhiệm vụ cụ thể và báo cáo Lãnh đạo Bộ phụ trách xem xét trước khi quyết định, bảo đảm thực hiện nghiêm chủ trương của Bộ Chính trị tại tại Công văn số 12400-CV/VPTW ngày 30/11/2024 của Văn phòng Trung ương Đảng.
Về định hướng sắp xếp tổ chức bộ máy tại Bộ NN&PTNT: Kết thúc hoạt động Ban cán sự đảng, lập Đảng bộ Bộ NN&PTNT theo yêu cầu và kế hoạch của Bộ Chính trị.
Định hướng sắp xếp các đơn vị thuộc Bộ như sau:
Đối với các tổ chức hành chính, tiếp tục duy trì 2 Cục: Cục Kinh tế hợp tác và Phát triển nông thôn và Cục Quản lý đê điều và Phòng, chống thiên tai.
Tiếp tục duy trì 6 đơn vị tham mưu tổng hợp, sẽ hợp nhất với các đơn vị tương ứng của Bộ Tài nguyên và Môi trường (TN&MT), bao gồm: Vụ Hợp tác quốc tế; Vụ Khoa học và Công nghệ, Vụ Pháp chế, Vụ Tổ chức cán bộ, Văn phòng Bộ, Thanh tra Bộ.
Hợp nhất Vụ Kế hoạch và Vụ Tài chính, đồng thời, hợp nhất với Vụ Kế hoạch - Tài chính (Bộ TN&MT); Hợp nhất Cục Thủy lợi và Cục Quản lý Xây dựng công trình thành Cục Quản lý và Xây dựng công trình Thuỷ lợi; Hợp nhất Cục Trồng trọt và Cục Bảo vệ thực vật thành Cục Trồng trọt - Bảo vệ thực vật; Hợp nhất Cục Chăn nuôi và Cục Thú y thành Cục Chăn nuôi - Thú y; Hợp nhất Cục Lâm nghiệp và Cục Kiểm lâm thành Cục Lâm nghiệp - Kiểm lâm; Hợp nhất Cục Thủy sản, Cục Kiểm ngư và Cục Chất lượng, Chế biến và Phát triển thị trường thành Cục Thủy sản - Kiểm ngư.
Đối với đơn vị sự nghiệp công lập thuộc Bộ - Đối với đơn vị thuộc cơ cấu tổ chức của Bộ: Sẽ duy trì 5 đơn vị có tên trong cơ cấu tổ chức của Bộ tại Nghị định số 105/2022/NĐ-CP, bao gồm: Viện Chiến lược và Chính sách NNNT; Trường Cán bộ quản lý nông nghiệp và Phát triển nông thôn; Báo Nông nghiệp Việt Nam; Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn; Trung tâm Chuyển đổi số và Thống kê nông nghiệp.
Các đơn vị này sẽ hợp nhất với các đơn vị có chức năng tương ứng của Bộ TN&MT khi sáp nhập.
Trung tâm Khuyến nông quốc gia duy trì là đơn vị sự nghiệp thuộc cơ cấu tổ chức của Bộ; Tiếp tục duy trì Trường Chính sách công và PTNT theo hướng không thuộc cơ cấu tổ chức và thực hiện lộ trình sắp xếp phù hợp với quy hoạch mạng lưới các cơ sở giáo dục đại học theo quyết định của cấp có thẩm quyền.
Đối với các đơn vị sự nghiệp công lập khác thuộc Bộ sẽ nghiên cứu các phương án, sắp xếp, tô chức lại trong quá trình hợp nhất hai Bộ để báo cáo cấp có thẩm quyền xem xét, quyết định.